研究所的前身是国家地震局分析预报中心，成立于1980年。2004年，根据中国地震局关于直属科研机构管理体制改革组织实施意见要求，分析预报中心的短临预测研究和任务性工作从科研机构中划转出去，约130人到新组建的中国地震台网中心；分析预报中心更名为地震预测研究所，以地震监测、地震预测理论方法与观测技术为主要研究领域，负责全国地震分析预测科学技术集成的研究工作。
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